事业单位在开具发票时，主要遵循以下规定：

发票类型

事业单位一般不需要增值税专用发票，而是使用增值税普通发票。在开具增值税普通发票时，只需填写单位名称，无需输入税号。

开票对象

事业单位在开具发票时，应确保购买方为单位名称，并提供统一社会信用代码或组织机构代码。这些信息用于在税控系统中据实开具发票。

特殊票据

对于经过省级以上财政物价部门批准的行政事业收费项目，事业单位可以使用行政事业收费基金票据，其作用等同于企业发票。收取的款项一般应上缴财政，实行收支两条线管理。

内部往来

单位内部或单位之间的非结算资金往来，应使用收据。有些事业单位若开展经营性质的业务，则应当使用发票。

开票系统

开具发票时，事业单位应通过税控系统进行，并确保发票内容与实际销售情况相符。若通过销售平台系统与增值税发票税控系统后台对接开票，系统导入的开票数据内容也必须与实际交易相符。

免税情况

政府、事业单位、医院、军队、学校、个人等不属于企业，因此在开具发票时可以不填写纳税人识别号，并且在没有税号的情况下也可以不用开票。

综上所述，事业单位在开具发票时，主要使用增值税普通发票，并确保提供正确的单位名称和必要的代码信息。对于特定的行政事业收费项目，可以使用行政事业收费基金票据。内部资金往来使用收据，经营业务则需开具发票。开票过程应通过税控系统进行，并保证发票内容的真实性。