当会计凭证丢失时，可以采取以下步骤进行处理：

确认遗失

确认凭证确实丢失，并了解丢失的具体情况。

报告遗失

立即通知上级管理部门，并按照公司的规定程序报告遗失情况。

记录遗失

记录遗失的详细情况，包括遗失的凭证类型、日期、金额等，并保存好相关通讯记录。

重建凭证

如果是手工记账，重新制作一份与原来相同的凭证。

如果使用财务软件，从系统中打印出相应的凭证。

对于发票类原始凭证，从开票单位获取存根联的复印件。

对于银行单据，联系银行补打银行回单。

修改账目

在会计账簿上根据原始凭证的内容进行记账，并将补充凭证的信息也记录在账簿上。

防止再次遗失

加强凭证的安全管理，如改进凭证存放环境、使用安全技术确保凭证安全可靠。

开发凭证查询功能，定期抽查和管理凭证，确保凭证的完整性和正确性。

遵守法规

根据《会计法》规定，对于未按规定保管而导致凭证丢失的，可能会对企业负责人进行处罚，严重者可能取消会计资格并追究刑事责任。

请根据具体情况采取相应措施，并确保所有操作符合会计原则和法规要求