南通有三所本科大学，分别是：

南通大学：

这是一所涵盖经济学、文学、理学、工学、医学、管理学和艺术学等七大学科门类的综合性大学，由江苏省人民政府和交通运输部共建，是江苏高水平大学建设高峰计划建设高校。

南通理工学院：

这是一所民办本科大学，由江苏省教育厅主管，位于南通市。

南通大学杏林学院：

这是南通大学的一个三本学院，同样由江苏省教育厅主管，位于南通市。

以上信息根据最新的参考资料整理得出，具体专业设置请参考各大学的官方网站或教育部门发布的最新信息