荆门市直包括以下单位：

1. 荆门市人民政府办公室

2. 荆门市人民政府法制办公室

3. 荆门市人民政府外事办公室

4. 荆门市人民政府发展和改革委员会

5. 荆门市人民政府财政局

6. 荆门市人民政府人力资源和社会保障局

7. 荆门市人民政府教育局

8. 荆门市人民政府科技局

9. 荆门市人民政府文化旅游广电局

10. 荆门市人民政府卫生健康委员会

这些单位属于荆门市直管的机关事业单位。