药学理论涵盖了多个领域，主要包括但不限于以下内容：

中药学基本理论

研究中药的概念、起源和发展。

探讨中药的产地与采集、药材的概念。

阐述中药炮制的目的、方法。

解释中药的药性、治病的机理。

讨论中药配伍的原则、药物“七情”的概念。

阐述用药禁忌、剂量与用法。

药理学

研究药物与机体（包括病原体）之间的相互作用及其规律。

包括药效动力学（研究药物对机体的作用及作用原理）、药代动力学（研究药物在体内的过程）。

探讨药理效应（药物作用下机体的生理生化功能变化）和药物的选择性。

药物代谢动力学

研究药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程。

生物利用度理论

探讨药物进入体循环的速度和程度。

药物制剂稳定性理论

研究药物制剂在一定条件下的物理化学稳定性。

给药系统理论

研究药物给药的方式、方法和策略。

其他理论

如藏医药学中的五源理论，认为药物的性质、味道和效果与五行（土、水、火、风、空）有关。

苗族药学中，认为毒、亏、伤、积、菌、虫是导致疾病的六大因素，治疗基于透皮吸收和经络传导。

药学理论为临床合理用药、药物研发、疾病防治提供了重要的理论基础