医学专业自考存在多重限制，主要原因包括：

医学专业要求高：

医学专业要求学生必须接受系统的教育，包括理论学习和实践技能的培养。自学难以保证医学知识和技能的全面性和准确性。

关乎人民安全：

医学专业直接关系到人们的健康和安全，因此必须确保从业者具备相应的资格和能力。

招生和就业政策变化：

过去，由于高校招生规模有限，允许医学专业自考以缓解医学生缺口。但随着高校扩招和医学生不再包分配，国家于2006年取消了医学类专业的自考。

学历认证问题：

没有国家承认学历的医学教育必须通过全日制高等教育进行，医学专业通常从本科开始，面向应届高中毕业生招生。

专业限制：

目前，全国各地的自考都不开设医学类专业，包括临床医学等，且自2002年10月30日起，自考获得的学历不能用于报考职业医师证。

在职人员限制：

医学类院校的自考主要针对在职人员，非在职人员或应往届高中毕业生不能报考。

综上所述，医学专业自考存在多重限制，主要是由于医学教育的特殊性、关乎公共安全和健康、以及国家教育及就业政策的调整。