工程结算款的做账流程通常包括以下几个步骤：

收集原始资料

收集工程合同、施工图纸、材料清单等，作为核算的基础。

计算工程量

根据合同约定和实际施工情况，计算完成的工程量。

确定工程款

按照工程量清单和计价规则，确定应收的工程款金额。

会计分录

收到款项时，借记“银行存款”或“应收账款”等科目，贷记“预收账款”或“工程结算”科目。

工程成本发生时，借记“工程施工”科目，贷记“银行存款”或应付账款等科目。

工程结算时，借记“工程结算”科目，贷记“工程施工”科目。

编制会计报表

编制资产负债表、利润表等，确保账目清晰、准确。

审核与登记

核实和登记结算信息，审核结算支取资金，并在账簿中记录结算支出。

税务处理

根据税法规定，缴纳相应的所得税，并开具合法的发票。

保管结算单据

工程结算单应妥善保管，以备查验，并记录拨付款情况，以便及时对账。

在整个过程中，需要确保记录的真实性和完整性，并遵循会计准则和相关法规。