总公司管理分公司通常采取以下方法：

1. 制定公司文件，明确总公司与分公司的关系，规定分公司负责人的权限及越权的法律责任。

2. 签订目标责任书，细化监管方式，包括财务控制、合同管理、资产监管、人事管理等。

3. 定期审计分公司财务，确保财务记录准确无误。

4. 统一管理人事，包括员工的招聘、解聘等，确保人事管理的规范性和合法性。

5. 保持管理制度一致性，确保分公司的管理制度与总公司保持一致。

6. 明确授权和责任，防止权力过度集中或滥用。

7. 监控和审查分公司业务，确保业务操作符合法律和总公司的政策。

8. 授权控制、预算管理、会计核算、审计监督等方式管理分公司财务。

9. 委派财务人员，实行收支两条线管理，设置收款专户和费用专户。

10. 建立完善的内部控制制度，包括三大本制度，确保财务业务有法可依。

11. 加大内审力度，对违规进行严格管理。

12. 定期对分公司员工进行业务、法律培训，提高员工素质。

13. 设立有效的激励机制，提供优越的晋升条件。

14. 分公司经理与管理共同审核费用，严控费销比。

15. 每月向总公司报送分公司财务报表、费用报表、销售情况分析等。

16. 推广企业文化，加强员工内部凝聚力及高度的责任心。

17. 每日由业务和财务向总公司报送分公司日志，包括明日工作安排。

18. 应对政府部门检查，如分公司无法处理，应在第一时间上报至总公司经理。

19. 分公司经理应广招贤才，注重用人，为企业培养可靠的后备干部。

20. 制订分公司章程，并按照章程规定，对分公司控股管理。

这些方法有助于总公司有效地管理和控制分公司，减少因管理不善导致的责任承担风险