医师资格证书的办理流程通常包括以下几个步骤：

参加医师资格考试：

首先需要通过参加医师资格考试取得医师资格证书。

准备申请材料：

在取得资格证书后，需要准备以下材料进行医师执业注册：

医师执业注册申请审核表；

近期2寸白底免冠正面半身照片；

医师与拟聘机构签订的劳务合同或聘用证明；

身份证原件及复印件；

医师执业注册承诺书。

提交申请：

将准备好的材料提交至市行政服务中心市卫生计生局。

审核与领证：

窗口服务人员核验申请材料，当场作出受理决定。材料齐全且格式规范的情况下，予以受理，并出具行政许可申请受理通知书。符合审批条件的，将出具医师执业证书。

领取证件：

申请人可以按照约定的方式到市行政服务中心取证窗口自取或以邮寄的方式领取医师执业证书。

请注意，以上流程和所需材料可能会根据当地卫生健康行政部门的具体规定有所变化，建议直接咨询当地的卫生健康行政部门获取最新信息。