工程公司缴纳税务通常包括以下几种：

增值税

一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，适用一般计税方法时，预缴率为2%。

适用简易计税方法时，预缴率为3%。

企业所得税

建筑企业所属二级或二级以下分支机构直接管理的项目部不就地预缴企业所得税。

个人所得税

通常由业主代扣代缴。

其他税费

城建税、教育费附加、地方教育费等，根据增值税的一定比例缴纳。

社会保险费

由建设单位在工程开工前一次性缴纳，作为工程造价的组成部分。

印花税

按合同价款的0.03%缴纳。

缴税的具体流程和税率可能会根据最新的税法规定和地方政策有所变化，因此建议咨询当地税务机关或专业税务顾问以获得最准确的信息。