工程尾款的记账方法如下：

1. 当收到工程尾款时，会计分录应反映公司已经收到款项，同时保持预收或应收款项的准确余额。

借：银行存款/应收账款

贷：预收账款——预收工程款

或

贷：应收账款——应收工程款

2. 当支付工程尾款时，会计分录应反映款项的支付情况。

借：在建工程

贷：银行存款

如果涉及到发票问题，则会计分录可能会有所不同：

如果发票未到，会计分录为：

借：预付账款

贷：银行存款

如果发票已到，会计分录为：

借：在建工程

贷：预付账款

请根据具体情况选择合适的会计分录进行记账。