处理税控发票的入账流程通常包括以下几个步骤：

确认发票信息

验证发票的正确性和有效性，确保发票信息无误。

整理票据信息

根据凭证业务规则，结合发票实物，整理出正确的票据信息。

做账

根据发票内容，做出正确的借贷分录，并录入账簿。

会计检查

由会计检查记录的准确性。

税控系统审核

在税控系统中进行审核，确认发票信息准确无误。

更新税控系统

上传发票信息至税控系统。

会计账簿记录

将相关信息写入会计账簿。

对于税控发票的抵扣处理，如果是防伪税控金税盘，允许全额抵扣，账务处理如下：

购入专用设备时：

借：管理费用（价税合计额）

贷：银行存款/库存现金/应付账款

抵减增值税应纳税额时：

借：应交税费—应交增值税（抵减增值税）

贷：管理费用

请注意，具体的会计处理可能因企业的会计政策和所在国家的税法规定而有所不同。务必遵循当地的会计准则和税法规定进行操作。