注册会计师在进行财务报告内部控制审计时，涉及企业内控的主要方面包括：

控制环境相关的控制：

涉及企业文化、管理层和员工的诚信、组织结构等。

针对关联方交易的控制：

确保与关联方的交易是公平和透明的。

针对重大非常规交易的控制：

管理那些不常发生或非标准交易的控制措施。

监督其他控制的控制：

对内部控制系统的有效性进行监督和评价。

内部控制审计的目的是评估企业内部控制系统的有效性，确保财务报告的可靠性。