南京二级建造师挂靠的费用因专业、工作经验、专业技能、证书持有情况等因素而有所不同。根据最近的信息，以下是南京二级建造师挂靠费用的大致范围：

建筑工程专业：初始6千-7千/年，转注8千-1万/年。

机电工程专业：初始1-1.3万/年，转注1.5-2万/年。

市政公用专业：初始1-1.3万/年，转注1.5-2.2万/年。

公路工程专业：

1.5-2万/年。

水利水电专业：2-2.5万/年。

请注意，这些价格可能随市场情况有所变动，并且挂靠行为可能涉及法律风险，建议谨慎考虑。