当企业在开票时获得折扣，其入账方式应遵循以下步骤和原则：

确认折扣金额

如果折扣与销售同时发生，并且销售额和折扣额在同一张发票上分别注明，则可以将折扣后的余额作为销售额计算增值税。

会计分录

当收到带折扣的增值税发票时，应将折扣额计入财务费用，并将入账金额按折扣后的金额记入主营业务收入。

具体会计分录如下：

借：银行存款/库存现金 （票据总额）

借：财务费用 （折扣额）

贷：应交税费-应交增值税（销项税额） （（票据总额-折扣额）*17%）

贷：主营业务收入 （（票据总额-折扣额）-销项税额）

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期末处理

应收账款应减去销售折扣，以得出期末应收款。

政策依据

根据《国家税务总局关于纳税人折扣折让行为开具红字增值税专用发票问题的通知》（国税函1279号），在销售方给予购货方折扣或折让时，可以开具红字增值税专用发票。

请根据具体情况选择合适的会计处理方法，并确保遵循当地税法和会计准则。