大同大学目前设有16个系，包括工程学院、法学院、教育科学与技术学院、体育学院、文学院、新闻与传媒学院、云冈学学院、外国语学院、马克思主义学院、音乐学院、美术学院、数学与统计学院、物理与电子科学学院（通用航空学院）、化学与化工学院（新能源学院）、计算机与网络工程学院（大数据学院）、农学与生命科学学院、医学院、中医药健康服务学院、护理学院、商学院（对外经贸学院）、机电工程学院、建筑与测绘工程学院、煤炭工程学院和继续教育学院。

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