代发工资的开票方式如下：

开具发票类型

企业支付劳务费用时，应开具 差额发票，即按收款与付款的差额征税处理。

劳务发票属于地税局，个人或用人单位可携带身份证和劳务合同到公司所属地的地税局大厅开具。

会计处理

代发员工工资时，会计分录为：借：其他应收款-×××公司，贷：银行存款（或库存现金），应交税费-个人所得税。

发票开具方式

企业提供人力资源外包服务时，应按“经纪代理服务-人力资源外包服务”科目开具发票，可选择以下方式之一：

全额开具普通发票；

分别开具增值税专用发票和普通发票；

通过差额征税模块开具增值税专用发票。

税率

代发工资部分可能适用0税率；

收取的管理费可能适用5%的税率。

注意事项

劳务报酬的发票要明确报酬名称、金额、税率以及纳税人识别号；

开票单位需提供劳务报酬收款人的身份证明和税务登记证。

请根据具体情况选择合适的开票方式，并确保遵守相关税法规定。