保函费用通常应计入财务费用科目。具体来说：

1. 当企业缴纳银行保函费时，会计分录为：

借：其他货币资金—保函保证金

贷：银行存款

2. 当企业支付银行保函费手续费用时，会计分录为：

借：财务费用—手续费用

贷：银行存款

财务费用科目涵盖了企业为筹集生产经营所需资金等而发生的筹资费用，包括利息支出（减利息收入）、汇兑损益以及相关的手续费等。

需要注意的是，根据不同的会计准则和实际情况，保函费用可能还有其他的会计处理方式，但上述是常见的会计处理方法。