根据提供的信息，清华大学工程博士的学费标准如下：

全日制工程博士（本部）的学费标准为每生第一学年9万元人民币，第二学年6万元人民币。

全日制工程博士（深圳）的学费标准为每生第一学年9万元人民币，第二学年3万元人民币，第三学年3万元人民币。

非全日制工程博士（北京）的学费标准为每生总计24万元人民币，分为三个学年，每个学年8万元人民币。

非全日制工程博士（深圳国际研究生院）的学费标准同样为每生总计24万元人民币，也分为三个学年，每个学年8万元人民币。

请注意，这些信息是基于2024年5月1日的数据，学费可能会有变动，建议直接咨询清华大学获取最新信息