二级建造师考试中的水利专业相比于建筑专业难度要大。以下是具体的比较：

考试通过率

建筑工程的通过率相对较高，有些省份可以达到40%以上。

水利工程的通过率较低，通常只有30%左右。

市场需求

建筑工程是市场需求量最大的专业，从业人员众多。

水利工程虽然也是重要领域，但相对来说市场需求较小。

证书价值

尽管水利专业考试难度大，但其证书价值通常高于建筑专业。

选择考试专业时，考生应根据自己的工作经验、未来工作发展前景及个人兴趣进行综合考虑。