三明学院共有11个学院，分别是：

1. 三明学院经济与管理学院

2. 三明学院艺术设计学院

3. 三明学院信息工程学院

4. 三明学院机电工程学院

5. 三明学院资源与化工学院

6. 三明学院建筑工程学院

7. 三明学院海峡理工学院

8. 三明学院文化传播学院

9. 三明学院体育与康养学院

10. 三明学院教育与音乐学院

11. 三明学院海外学院