南通市共有9所大学，它们分别是：

1. 南通大学

2. 南通理工学院

3. 南通大学杏林学院

4. 江苏工程职业技术学院

5. 南通职业大学

6. 南通科技职业学院

7. 江苏航运职业技术学院

8. 江苏商贸职业学院

9. 南通师范高等专科学校

其中，本科学校有3所，专科学校有6所