资本公积的合并处理取决于合并的类型，具体分为以下几种情况：

1. 同一控制下的控股合并：

长期股权投资入账价值和支付资产账面价值的差额，可以在借方，资本公积不足冲减的冲减留存收益。

2. 同一控制下的吸收合并：

资本公积的形成是由于净资产入账价值与发行股份面值总额的差额，应记入资本公积（资本溢价或股本溢价）。

如果资本公积的余额不足冲减，应相应冲减盈余公积和未分配利润。

3. 非同一控制下的吸收合并：

调整被投资方资产和负债价值（由被投资方账面调整到公允价值），差额计入资本公积。

如果考虑所得税，需要确认递延所得税，同时冲减确认的资本公积。

在合并财务报表中处理子公司资本公积时，需要遵循以下原则：

同一控制权下的企业合并：按照子公司原来账面上记录的价值将其资本公积并入整个合并财务报表之中。

非同一控制权下的企业合并：审慎评估子公司资本公积的公允价值，并在合并抵消操作时将母公司长期股权投资与子公司所有者权益进行充分抵消。

合并财务报表问题需要综合考虑企业合并的方式、相关资产和负债的公允价值等因素，以确保合并财务报表的精确性和合法性。

请根据您的具体情况选择合适的处理方法，并确保遵循相关会计和税务规定