南京的本科大学包括但不限于以下这些：

南京大学

东南大学

南京航空航天大学

南京理工大学

河海大学

南京农业大学

南京医科大学

南京师范大学

中国药科大学

南京财经大学

南京工业大学

南京邮电大学

南京林业大学

南京艺术学院

南京体育学院

南京信息工程大学

南京晓庄学院

金陵科技学院

南京工程学院

江苏警官学院

南京特殊教育师范学院

以上信息根据最近的数据更新整理而来，具体名单可能会有所变动，建议查询官方最新发布的数据以获得最准确的信息