报到证丢失后改派的流程如下：

补办报到证

持有身份证及毕业证复印件，到就业指导中心填写《补办申请表》并现场办理补办手续。

补办后若需改派，需同时携带原单位退函和新单位接收证明。

改派报到证

向原就业单位提出改派申请，并说明改派原因。

原单位同意后出具同意改派的退函，并经单位主管部门人事处同意。

新接收单位出具同意接收毕业生的接收证明（改派回生源地除外）。

持原《就业报到证》原件、原单位退函、新单位接收证明到就业指导中心办理改派手续。

改派后，持新《就业报到证》到户籍所在地派出所改迁户口，到档案所在地迁移档案关系。

请注意，改派通常在毕业三年内进行，超过三年可能需要到档案存放地办理人事关系调转。改派手续可能因地区或具体情况有所不同，建议联系当地就业指导中心获取最新信息