要验证南京的助理工程师证（助工证）的真伪，您可以采取以下几种方式：

人社局窗口查询

携带证书到南京市人社局的人工窗口进行查询。

工作人员会核实证书信息，并告知真假。

电话查询

拨打南京市人社局专业技术管理办的电话进行查询。

提供证书上的编号，工作人员会在系统中核实。

网函查询

向南京市人社局发函，请求查询证书的真伪。

人社局会回复查询结果。

请确保使用官方提供的联系方式和正确的证书编号进行查询，以确保查询结果的准确性。