亳州学院设有多个教学院系，主要包括：

1. 中文与传媒系

2. 电子与信息工程系

3. 经济与管理系

4. 教育系

5. 中药学院

6. 外语系

7. 生物与食品工程系

8. 美术系

9. 音乐系

10. 体育系

11. 马克思主义学院

此外，根据最新的信息，亳州学院还设有小学教育（师范）、学前教育（师范）、制药工程、中药学、药学、药物制剂、药物分析、护理学、医学检验技术、文化产业管理、汉语言文学、网络与新媒体、生物工程、生物制药、酿酒工程、食品科学与工程、食品营养与健康等专业。

请注意，专业设置可能会发生变动，建议以学校最新公布的信息为准