快递公司的员工工资应根据员工所在的部门和职责进行会计科目的归类处理。以下是具体的会计处理方法：

计提工资

如果员工属于管理岗位，工资费用应计入“管理费用”科目。

如果员工属于销售岗位，工资费用应计入“销售费用”科目。

如果员工从事物流运输业务，工资费用应计入“劳务成本”科目。

计提工资的会计分录为：

借：管理费用/销售费用/劳务成本-工资

贷：应付职工薪酬—工资

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实际支付工资

实际支付工资时，应根据上述科目进行发放，会计分录为：

借：应付职工薪酬—工资

贷：银行存款/库存现金/其他应收款等

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其他相关费用

社会保险费用（企业部分）计提和发放的分录分别为：

借：管理费用/销售费用—社保

贷：应付职工薪酬—社保

借：应付职工薪酬—社保

贷：银行存款

个人所得税的计提和发放分录分别为：

借：应付职工薪酬—工资

贷：其他应付款—代扣代缴款项（社保、公积金等）

借：其他应付款—代扣代缴款项

贷：银行存款

如果涉及司机等特定岗位，工资费用可能会计入“劳务成本”科目，并在确认收入后结转到“主营业务成本”科目。

请根据您公司的具体情况选择合适的会计科目进行账务处理。