黔南民族医学高等专科学校目前开设的专业包括：

1. 临床医学

2. 护理

3. 药学

4. 中药

5. 中药制药技术

6. 医学检验技术

7. 医学影像技术

8. 口腔医学技术

9. 药品经营与管理

10. 临床医学（全科医学方向）

11. 助产

12. 计算机信息管理（医学方向）

这些专业的学制均为三年。学校还设有少数民族班，专门面向贵州省招收少数民族考生。