当企业的进项税额超过销项税额时，通常会产生“增值税留抵税额”。企业可以根据以下几种方式处理这种情况：

留抵下期抵扣

将多余的进项税额留到下一期抵扣，即当下一期的销项税额大于等于留抵税额时，企业可以使用留抵税额进行抵扣。

退税

企业可以申请将增值税留抵税额退回。但请注意，如果退税金额超过当期销售额，可能会受到限制。

账务处理

对于多余的进项发票，可以选择不认证也不入账，而是将库存作暂估入库处理。次月再进行认证，并冲减暂估入库，然后按照发票入账。

将进项发票上记载的税额计入“应交税费-待认证进项税额”，不含税的金额计入成本费用科目，价税合计数计入“应付账款”等科目。

在后期认证并申报抵扣时，将对应的税额从“应交税费-待认证进项税额”贷方转入“应交税费-应交增值税（进项税额）”借方。

纳税申报表处理

在申报“增值税纳税申报表”时，会有一个上期留抵税额的栏目，多认证的进项税额会在此栏目体现。

数据核对与合规性检查

确认账务数据的准确性，核对发票信息，确保所有进项发票真实有效，并符合税务局规定。

纳税策略调整

检查企业的纳税策略是否合理，如有问题需及时调整，以降低税务风险和财务成本。

请根据企业的实际情况和当地税务局的具体规定选择合适的处理方式。需要注意的是，处理进项税额超出销项税额的情况时，企业应确保所有操作均符合税法规定，并在税务申报时进行相应处理