当企业遇到已付款但发票未到的情况，以下是常见的会计处理方式：

预付款处理

出纳根据会计凭证登记日记账，做银行支出。

先记入预付账款或其他应收款。

借：预付账款或其他应收款

贷：银行存款

货物到达但发票未到

根据不含税价款，做货物的暂估入库处理。

借：库存商品

贷：应付账款——暂估应付账款

跨年费用未付款未收到发票

在费用发生时，按企业实际支付的费用计入到对应的科目。

例如支付的房租，尚未取得发票的，先做如下分录：

借：管理费用—租金

贷：应付账款

汇算清缴时处理

如果汇算清缴还没有拿到发票，则应该调增利润，缴纳企业所得税。

税务处理

根据《国家税务总局关于企业所得税若干问题的公告》（国家税务总局公告2011年第34号），企业当年度实际发生的相关成本、费用，由于各种原因未能及时取得该成本、费用的有效凭证，在预缴季度所得税时，可暂按账面发生金额进行核算；但在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效凭证。

账务处理的注意事项

发票到达后，将之前的暂估入账进行冲销，然后根据发票内容进行正式入账。

如果企业客户很多或发票长期未到，可以每月暂估一次，并在发票到达时及时进行核对和冲销。

请根据具体情况选择合适的会计处理方法，并确保符合当地税法和会计准则的要求。