南京的三本院校包括：

1. 东南大学成贤学院

2. 南京大学金陵学院

3. 南京理工大学紫金学院

4. 南京航空航天大学金城学院

5. 南京师范大学中北学院

6. 南京医科大学康达学院

7. 南京中医药大学翰林学院

8. 南京信息工程大学滨江学院

9. 南京邮电大学通达学院

10. 南京财经大学红山学院

11. 南京审计学院金审学院

这些院校中，有些是排名较高的三本院校，例如东南大学成贤学院、南京大学金陵学院、南京理工大学紫金学院、南京航空航天大学金城学院等。

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