古代的特殊部门主要包括以下几种：

墨家死士：

先秦时期由民间高手自发成立的组织，主要针对各国发动侵略的主战成员进行暗杀，属于民间正义之师。

绣衣使者：

汉武帝时期形成的特殊部门，身穿绣衣，手持节杖和虎符，负责巡视并代天子行事，监督官员。

校事府：

三国时期曹魏建立，主要职能是侦察刺探官民，由曹操首创，权力很大。

内外侯官：

北魏到隋朝期间设立的监察部门，内侯官监察皇族宗亲及朝廷大臣，外侯官负责谍报活动。

皇城司：

宋代禁军官司，执掌宫禁并刺探情报。

锦衣卫：

明朝特务机构，由明太祖朱元璋设立，用于加强皇权，对百官监察。

东厂：

明成祖朱棣设立，由内宫太监担任最高指挥官，权力在锦衣卫之上。

西厂：

明孝宗朱见深设立，职权在东厂和锦衣卫之上。

粘杆处（血滴子）：

清朝特殊部门，初为抓蝉，后发展为特务组织，负责打探消息。

梅花内卫：

唐朝特殊机构，为武则天私人服务，用来打探违法官吏和诽谤议论她的人。