员工个人扣款的会计处理步骤如下：

计提工资

```

借：管理费用——工资——职工工资

贷：应付职工薪酬——工资

应交税费——应交税金——应交个人所得税

其他应付款——社保单位

其他应付款——公积金单位

```

发放工资

```

借：应付职工薪酬——工资

贷：银行存款

其他应收款——代付社保费

其他应收款——代付公积金费

营业外收入（缺勤扣款）

库存现金/银行存款（实发数）

```

代扣代缴款项 （如社保、公积金、个人所得税等）：

借：其他应付款——个人社保

贷：应付职工薪酬——社保单位

借：应付职工薪酬——社保单位

贷：银行存款

若涉及员工预支款项或其他应收款

```

借：其他应付款——个人公积金

贷：应付职工薪酬——公积金单位

借：应付职工薪酬——公积金单位

贷：银行存款

请根据实际业务发生的情况选择相应的会计分录进行处理，并确保所有分录准确无误。