公司代扣代缴个人所得税的会计入账处理通常遵循以下步骤：

计提工资费用

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借：管理费用/销售费用/职工薪酬/工资总额

贷：应付职工薪酬——工资总额

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发放工资时扣除个人所得税

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借：应付职工薪酬——工资总额

贷：银行存款

其他应付款——代扣代缴款项

应交税费——代扣代缴个人所得税

```

实际缴纳个人所得税

```

借：应交税费——代扣代缴个人所得税

贷：银行存款

以上会计分录反映了公司在发放工资时代扣代缴个人所得税，并在之后缴纳了相应的税款。请根据公司的具体情况调整会计科目。