福建省内大学数量最多的城市是福州市。以下是福建省内几个主要城市的大学分布情况：

福州市：拥有最多的大学，包括福州大学、福建师范大学、福建农林大学、福建医科大学等，共计约15所本科大学。

泉州市：有华侨大学、泉州师范学院、仰恩大学等，共有7所本科大学。

厦门市：以厦门大学最为著名，还有集美大学、厦门理工学院等，共有6所本科大学。

漳州市、 三明市、 龙岩市、 莆田市、 南平市：这些城市的本科大学数量相对较少。

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