制作运费凭证的步骤如下：

标注运费信息

在销售单中明确标注运费金额及支付方式。

制作运费明细表

根据销售单内容，制作包含订单号、商品名称、运费金额等信息的运费明细表。

归档运费明细

将运费明细表与销售单一同归档，作为运费支付的凭证。

保留支付凭证

当运费支付后，保留支付凭证，如银行转账记录或支付宝支付截图等。

整理凭证

将支付凭证与运费明细表和销售单整理，形成完整的运费凭证。

使用专业软件可以简化流程，系统自动计算运费金额并实时生成凭证，提高准确性和时效性。