绿化工程通常由以下部门负责：

园林部门：

负责园林绿化工程的管理，不同城市的园林部门设置可能不同，有的是一级部门，有的属于住建局或城管局。

住房和城乡建设部门 （住建部）：园林绿化行业的主管部门之一，负责城市绿化工程的规划、建设和管理。

林业局：

在部分情况下，绿化苗木的产销由国家林业局造林绿化管理司管理。

农业主管部门：

花卉生产等归地方政府农业主管部门管理。

环保部门：

绿化工作也属于环境保护的范围，一些地方由环保部门负责。

自然资源和规划部门：

负责城市绿线的监督和管理工作。

综合行政执法部门、 交通运输部门、 水利部门、 生态环境部门、 市场监管部门：

根据各自职责，配合绿化工程的实施和管理。

物业环境管理部门：

负责小区内的绿化维护、修缮和整治。

这些部门根据各自的职责和分工，共同参与城市绿化工程的规划、实施、监督和管理工作