注册会计师在审计中追求的目标主要包括：

财务报表的真实性和完整性：

确保财务报表按照适用的会计准则和相关会计制度的规定编制，并且公允地反映了被审计单位的财务状况、经营成果和现金流量。

编制和表述的合规性：

评价财务报表的编制和表述是否符合相关准则。

提供合理保证：

通过审计活动，注册会计师旨在获取足够的审计证据，以合理保证财务报表不存在由于舞弊或错误导致的重大错报，从而增强公众对财务信息的信赖。

与管理层和治理层的沟通：

根据审计结果，注册会计师需要按照审计准则的规定出具审计报告，并与管理层和治理层进行沟通。

这些目标指导着审计工作的进行，确保审计活动的有效性和效率