重庆规划局的主要部门包括：

1. 办公室：负责机关政务工作，如文电、会务、机要、档案等日常运转工作。

2. 总设计师办公室：负责规划编制管理工作。

3. 规划编制管理处：负责编制各类规划，如城市总体规划、分区规划等。

4. 区县规划管理处：负责指导区县（自治县）规划和自然资源管理。

5. 乡村规划管理处：负责乡村地区的规划管理工作。

6. 土地与房屋管理处：负责土地和房屋相关的规划管理。

7. 交通与市政工程处：负责交通和市政基础设施的规划管理。

8. 管理与服务处：负责规划局的管理和服务工作。

9. 综合业务处：负责规划局的综合性业务。

10. 建筑市场管理中心：负责建筑市场的规划和管理。

11. 房地产市场管理中心：负责房地产市场的规划和管理。