南京栖霞区拥有众多高校，主要包括：

南京大学仙林校区

南京师范大学仙林校区

南京中医药大学仙林校区

南京邮电大学仙林校区

南京财经大学仙林校区

南京审计大学金审学院仙林校区

南京理工大学紫金学院

南京师范大学中北学院

南京森林警察学院仙林校区

南京体育学院仙林校区

南京信息职业技术学院

南京工业职业技术大学

这些学校为栖霞区带来了丰富的教育资源和浓厚的学术氛围