当企业发生存货报损时，进项税额的处理取决于损失的原因。以下是不同情况下进项税额的会计处理方法：

管理不善造成的存货毁损

借：待处理财产损溢

贷：原材料/库存商品

借：管理费用

贷：待处理财产损溢

借：应交税费—应交增值税（进项税额转出）

自然灾害造成的存货毁损

借：待处理财产损溢

贷：原材料/库存商品

借：营业外支出

贷：待处理财产损溢

正常保管损耗

借：待处理财产损益-待处理流动资产损溢

贷：库存商品

借：管理费用

贷：待处理财产损益-待处理流动资产损溢

非正常原因导致的存货盘亏或毁损

这类损失通常指由于仓库管理人员监管不力等原因造成的损失，其进项税额不得抵扣，需要做转出。

请注意，以上会计处理方法遵循了相关税法规定，实际操作时应以当地税务部门的规定为准。