根据提供的信息，叙永县在乡村振兴、传统村落保护、经济发展等方面表现突出的乡镇包括：

摩尼镇

2021年度四川省乡村振兴先进乡镇。

2021年度四川省乡村振兴示范村包括摩尼镇联盟村。

水尾镇

水尾镇广木村上榜2021年度四川省乡村振兴示范村。

合乐苗族乡

方元村上榜2021年度四川省乡村振兴示范村。

分水镇

木格倒苗族村被列入第一批中国传统村落名录。

水潦乡

海涯彝族村被列入第2批中国传统村落名录，保留有丰富的彝族风情和自然风光。

正东乡

灯盏坪古村被列入第2批中国传统村落。

叙永镇

2024年中国西部地区综合竞争力百强乡镇之一。

龙凤镇