在选择吉林大学（吉大）和哈尔滨工程大学（哈工程）时，可以考虑以下几点：

学校定位和层次

吉大是985工程高校，通常意味着更高的教育质量和研究水平。

哈工程是211工程高校，同样享有较高的教育声誉。

学科优势

吉大在材料科学、化学、物理学、农学、动物学等领域有较高的学术声誉。

哈工程在船舶与海洋工程、核科学与技术、机械工程、电气工程等领域享有盛誉。

专业选择

如果对船舶、海洋工程、核科学与技术感兴趣，哈工程可能是更好的选择。

对于文学、法学、医学等专业，吉大可能有更强的实力。

地域和就业

哈工程位于哈尔滨，可能提供更多的实践机会和与船舶行业的紧密联系。

吉大位于长春，可能在就业平台和考研平台上有更广泛的选择。

录取分数线

录取分数线因省份和年份而异，通常吉大的录取分数线会比哈工程高。

个人兴趣和职业规划

选择学校时，应考虑个人的兴趣和未来的职业规划。

如果对特定专业有浓厚兴趣，应优先考虑该专业的强势学校。

综上所述，没有绝对的“哪个更好”，而是应该根据个人的专业兴趣、未来职业规划以及各学校的优势进行综合考虑。