研究生毕业后，档案的处理方式主要有以下几种：

考研或继续深造

如果选择继续深造，如考博，可以申请将档案暂时留在学校，通常保留期限为2年。

在保留期间，一旦考上研究生或找到工作，需凭相关证明办理档案转递。

就业单位

如果找到工作，且单位具备档案管理权限（如国企、事业单位），可将档案存放在单位。

若在私企或外资企业工作，通常需要将档案存放在工作地的人才中心。

人才市场或人才交流中心

对于未就业或单位不负责档案管理的情况，可以将档案存放在户籍所在地或创业地区的人才市场。

档案存放在人才市场一般需要支付一定的服务费用，具体费用和政策需咨询当地人才市场。

档案留校

部分学校允许毕业生申请档案留校，但通常有期限限制，如2年，之后需将档案转走。

档案激活

如果档案在自己手中，需要先激活，然后存放在具有档案管理权限的地方，如工作单位或人才中心。

请注意，档案是个人重要的身份和经历证明，务必妥善保管，并确保存放在有合法管理权的机构。