中医医师资格证书的注册流程通常包括以下几个步骤：

准备材料

《医师注册申请表》

医师资格证原件及复印件

身份证原件及复印件

二甲医院以上的体检证明原件

医疗机构聘书或合同复印件

2寸免冠照片若干张

提交申请

到市卫生局或相应的卫生健康行政部门提交申请。

如果是电子化注册，需要登录医师电子化注册系统，按指示填写个人信息并提交申请。

等待审核

卫生健康行政部门会对提交的材料进行审核。

对于中止执业活动两年以上或不符合注册条件的医师，可能需要接受额外的培训或考核。

领取执业证书

审核通过后，医师可以领取《医师执业证书》，这是执业的重要凭证。

请注意，具体的注册流程和要求可能会根据地方卫生健康行政部门的规定有所不同，建议直接咨询当地的卫生健康行政部门获取最准确的信息。