物流企业在开具增值税发票时，根据纳税人类型和提供的服务类型，税率可能有所不同。以下是物流企业在开具发票时可能适用的税率：

一般纳税人

提供运输服务适用的增值税税率为 9%。

货运业增值税发票的税率是 11%，可以开具运费。

增值税专用发票的税率是 6%，可以开具仓储费、搬运费等。

小规模纳税人

提供运输服务的增值税征收率为 3%。

请注意，税率可能会根据最新的税法规定和税务部门的调整而变化。因此，在开具发票之前，建议咨询当地税务机关或专业税务顾问以获取最准确的税率信息。

另外，发票开具的金额通常不应超过价税合计金额的30万元。