应用数学考研的科目主要包括以下几门：

思想政治理论：

这是所有考研学生必考的科目，主要考察学生的政治理论知识和思想道德素质。

英语：

数学与应用数学专业的考研英语一般分为英语一和英语二，主要测试学生的英语阅读、写作、翻译和听力能力。

数学分析：

这是数学与应用数学专业考研的核心科目之一，主要考察学生对微积分、实变函数、复变函数等基本概念和理论的掌握程度。

高等代数（或代数与几何）：高等代数主要研究线性空间、线性变换、矩阵理论等内容，而代数与几何则涵盖几何学的相关内容。这两门科目在考研中通常会考察学生对抽象代数概念的理解以及运用代数方法解决实际问题的能力。

此外，根据不同的学校和专业方向，还可能包括其他课程，如常微分方程、概率论与数理统计、数值分析、运筹学等。这些课程通常作为选修课或限定选修课，旨在深化学生在特定领域的学习和研究能力。

总体来说，应用数学考研的科目设置旨在全面考察学生的数学基础理论知识以及运用这些知识解决实际问题的能力。建议考生在备考过程中，注重基础知识的巩固和实际应用能力的培养。