建筑公司收到工程款的入账流程通常包括以下几个步骤：

1. 收到预付工程款时：

2. 工程完工结算时：

2. 工程完工结算时：

3. 结转收入时：

3. 结转收入时：

借：工程结算收入

贷：本年利润

4. 收到全部工程款时：

借：银行存款

贷：应收账款-业主

5. 支付分包单位工程款时：

借：应付账款-分包单位

贷：其他应付款-代扣代缴税费

借：银行存款

贷：应收账款-业主

7. 计提和缴纳相关税费时：

借：税金及附加

贷：应交税费-增值税、城建税、教育附加

借：应交税费-增值税、城建税、教育附加

贷：银行存款