处理结存发票的方法取决于具体情况，包括发票是否已使用、是否已作账务处理等因素。以下是几种常见情况的处理方法：

发票金额或税额多开或少开

若双方未作账务处理，购货方可将原发票联和抵扣联退回，销货方重新开具正确的发票，并将原发票联、抵扣联和记账联加盖“作废”戳记。

发票金额或税额少填

若一方或双方已作账务处理，销货方需补开一张蓝字专用发票，并在备注栏说明情况，同时进行纳税申报。

发票金额或税额多填

若销货方已作账务处理而购货方未作账务处理，购货方可将原发票联、抵扣联退回销货方，销货方重新开具发票。

若购销双方均已作账务处理，购货方可向税务机关申请办理“销货退回折让”手续，取得红字发票，各自冲减销售金额、销项税金和进项金额、进项税额。

发票退回或作废

纳税人可将税控系统中结存的发票开具完，或作废后办理税控设备注销。

结存纸质发票较多时，可通过电子税务局发起发票退回申请，或作废并验旧原税控设备中未开具的空白结存纸质发票。

税务申报

在税务申报中，要正确声明未使用的库存发票数量。

废旧发票处理

对已过期或损坏的发票，按照税务规定进行废旧处理，一般需要将废旧发票进行注销或销毁。

发票保管

纳税人发票保管满5年后，报经税务机关查验后销毁。

发票管理系统

清理发票结存时，需核对发票的实际情况，确保所有已开发票都已使用或已报账，然后通过发票管理系统进行清零操作。

请根据您的具体情况选择合适的处理方法，并确保遵守相关税法规定。如有疑问，建议咨询当地税务机关或专业税务顾问